plink -- snp

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plink -- snp

2017年1月25日 — plink.assoc which contains the fields: CHR Chromosome SNP SNP ID BP Physical position (base-pair) A1 Minor allele name (based on whole ... ,2017年1月25日 — possibly transposing the genotype file (SNPs as rows); possibly recoding the SNP to an additive and dominant pair of components; possibly ... ,跳到 Extracting a SNP of interest — A phenotype has been simulated based on the genotype at one SNP. In this tutorial, we will walk through using PLINK to ... ,2017年1月25日 — Read data in a variety of formats; Recode and reorder files; Merge two or more files; Extracts subsets (SNPs or individuals); Flip strand of SNPs ... ,2017年1月25日 — SNP scoring routine. PLINK provides a simple means to generate scores or profiles for individuals based on an allelic scoring system involving ... ,低頻率的SNP 往往沒有足夠的統計檢力(statistical power),以PLINK 中的”--freq”指令進. 行計算,共8,571 個SNPs 的MAF 小於5%。 Page 12. 11. 四、 基因定型 ...

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KiTTY
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plink -- snp 相關參考資料
plink --bfile mydata --logistic - PLINK: Whole genome data ...

2017年1月25日 — plink.assoc which contains the fields: CHR Chromosome SNP SNP ID BP Physical position (base-pair) A1 Minor allele name (based on whole ...

https://zzz.bwh.harvard.edu

plink --file data --filter myfile.raw 1 - PLINK: Whole genome ...

2017年1月25日 — possibly transposing the genotype file (SNPs as rows); possibly recoding the SNP to an additive and dominant pair of components; possibly ...

https://zzz.bwh.harvard.edu

PLINK tutorial - PLINK: Whole genome data analysis toolset

跳到 Extracting a SNP of interest — A phenotype has been simulated based on the genotype at one SNP. In this tutorial, we will walk through using PLINK to ...

https://zzz.bwh.harvard.edu

PLINK: Whole genome data analysis toolset

2017年1月25日 — Read data in a variety of formats; Recode and reorder files; Merge two or more files; Extracts subsets (SNPs or individuals); Flip strand of SNPs ...

https://zzz.bwh.harvard.edu

SNP scoring routine - PLINK

2017年1月25日 — SNP scoring routine. PLINK provides a simple means to generate scores or profiles for individuals based on an allelic scoring system involving ...

http://zzz.bwh.harvard.edu

目錄 - 臺灣人體生物資料庫

低頻率的SNP 往往沒有足夠的統計檢力(statistical power),以PLINK 中的”--freq”指令進. 行計算,共8,571 個SNPs 的MAF 小於5%。 Page 12. 11. 四、 基因定型 ...

https://www.twbiobank.org.tw